Ekstrimisme yang melibatkan kekerasan berangsur-angsur berubah bentuk jadi kelompok-kelompok kecil yang bertindak sendirian terlepas dari organisasi jihad besar – tapi kadang-kadang dengan dukungan mereka. Perubahan ini sebagian akibat efektifnya penegakan hukum yang telah menghasilkan penangkapan secara meluas dan melemahkan struktur Jemaah Islamiyah (JI), Jama’ah Anshorut Tahuid (JAT) dan organisasi-organisasi lain yang dituduh terkait terorisme. Tapi perubahan ini juga merupakan dampak dari pergeseran ideologi yang sekarang lebih condong ke aksi jihad yang bersifat “individual” dibandingkan “organisasional”, berbiaya rendah dan sasaran pembunuhannya berskala kecil daripada sebelumnya yang berupa serangan yang menewaskan korban masal dan secara tidak sengaja memakan korban muslim juga. Bom bunuh diri yang terjadi di sebuah masjid di dalam kompleks Mapolresta Cirebon tanggal 15 April 2011 dan serangkaian bom surat yang dikirim dan beredar di Jakarta pada pertengahan bulan Maret menjadi penanda pergeseran ideologi ini. Pemerintah perlu segera menyusun strategi-strategi pencegahan untuk mengurangi kemungkinan kelompok-kelompok semacam ini semakin banyak muncul.

Tak seperti para pendukung kelompok-kelompok jihad kecil, orang-orang yang menyokong jihad “organisasional” percaya bahwa mereka tidak akan bisa mencapai cita-cita mereka mendirikan negara Islam tanpa organisasi besar serta pemimpin yang kuat. Mereka juga percaya untuk meraih cita-cita mereka, maka penting sekali untuk membangun dukungan publik. Daripada terlibat dalam aksi terorisme, kelompok-kelompok seperti JI dan JAT saat ini fokus pada upaya membangun sebuah basis massa, dengan mencari isu-isu yang dekat dengan target dakwah mereka. Semakin lama hal ini membuat mereka fokus pada “musuh-musuh” lokal daripada asing, dengan sasaran para pejabat yang dilihat sebagai penindas, terutama polisi; kaum Nasrani; dan anggota aliran Ahmadiyah, menempati urutan teratas. Hal ini juga berarti mereka lebih bersedia untuk membentuk koalisi-koalisi dengan kelompok-kelompok non-jihadi dibanding di masa lalu.

Dalam beberapa hal, kedua arus jihadisme ini bisa saling melengkapi. Organisasi yang lebih besar bisa membiayai dakwah-dakwah yang menarik orang-orang yang potensial untuk jadi anggota kelompok-kelompok kecil ini. Mereka juga bisa menyediakan penterjemah dan distributor untuk materi-materi yang di-download dari situs-situs ekstrimis berbahasa Arab atau Inggris yang menunjang pendekatan kelompok-kelompok kecil. Mereka bisa mempertahankan sanggahan yang masuk akal atas aksi-aksi kekerasan sambil berusaha terus membangun kembali posisi mereka, dan pada saat yang sama menyediakan semacam cover yang dari bawahnya kelompok-kelompok kecil muncul. Organisasi-organisasi yang lebih besar belum meninggalkan jihad, hanya menundanya.

Laporan ini melakukan studi kasus mengenai kelompok-kelompok kecil yang menggunakan kekerasan yang muncul di Indonesia tahun 2009 dan 2010 di wilayah Sumatera yaitu Medan dan Lampung serta di Jawa yaitu di Bandung dan Klaten. Semuanya melibatkan sedikitnya seorang mantan napi; tiga dari empat kelompok punya hubungan dengan JAT tapi beroperasi sendiri terlepas dari kontrol JAT. Tiga dari empat kelompok ini juga terkait dengan kelompok-kelompok pengajian yang lambat laun berubah menjadi pasukan tempur, dan semuanya berkomitmen pada ightiyalat, operasi pembunuhan mendadak. Tak satupun dari anggota kelompok yang dikaji ini menjadi radikal karena faktor kemiskinan.

Informasi mengenai kelompok-kelompok kecil ini baru didapat karena anggota mereka tertangkap. Hal ini menimbulkan pertanyaan seberapa banyak kelompok kecil lainnya yang belum diketahui, biasanya kelompok ini baru diketahui ketika salah satu operasi pembunuhan mereka berhasil.

Strategi-strategi pencegahan yang tidak hanya bersifat penegakan hukum sangat diperlukan, dan Badan Nasional Penanggulangan Terorisme (BNPT) yang baru dibentuk memiliki peran penting dalam mendesain dan mengujinya. Namun, semua stragegi ini harus berdasarkan penelitian lapangan yang dan dituntun oleh studi yang sungguh-sungguh mengenai apa yang sudah dan belum berjalan dengan baik di tempat lain.